人材育成

　従来のスーパーコンピューターは、大型の数値計算を高速に実行することに最適化されていましたが、ビジネス分野はもちろん、科学技術分野の中でも、数理統計解析や機械学習を多用する分野では必ずしも性能が得られませんでした。

　一方、最新のスパコンは、民生用に広く使われている汎用CPUと、GPUなどの加速用ハードウェアを精緻に組み合わせた構成が主流になっており、クラウドとの共通点も多くあります。これまでクラウドを利用してきたユーザが気軽に、より高速に情報処理できる可能性が高まっており、スパコン／クラウドの混用も可能です。今回のTonomachi Cafeでは初めに、東京工業大学が導入するTSUBAME3.0システム等のＡＩ向けスパコンの潮流について紹介し、産業利用への期待をお話しします。

　そして、これまで実施してきた大規模応用研究から２つの事例を紹介します。　

　１つ目の事例は、タンパク質分子間ドッキングに関する計算です。従来は、１対１の計算だけでも数時間かかっていたため、相互作用が既知であるペアを計算で検証する程度でしたが、高速フーリエ変換の活用と、マルチGPU化等の工夫により今では百万ペアの計算が可能です。このシステムを利用して、肺がんなどをターゲットとした新しい創薬標的探索などの研究が進んでいます。

　２つ目の事例は、ヒトの腸内や口腔内の細菌に関するメタゲノム解析で必要とされる大規模な文字列比較の問題で、既存技術の数万倍の高速化を達成しました。 紹介事例はバイオ寄りですが、大型のスパコンやクラウドを利用することで、何年もかかるはずの計算が半日で実施できるという現状を紹介します。